Pour Nagios 2.9, il s'agit de corrections de bug ou une meilleure détection lors de la phase "./configure" pendant la compilation. Le script d'arrêt et de redémarrage de Nagios est encore une fois modifié. Ce script a connu de nombreux problèmes. Lors de nombreux arrêts/redémarrages, il est possible que le processus Nagios ne soit pas correctement arrêté. Avec pour conséquence la présence de plusieurs démons Nagios simultanément sur le serveur. Attention: je parle bien entendu de plusieurs démons pas de plusieurs processus. Il est tout à fait normal de trouver plusieurs processus Nagios car comme de nombreux démons, Nagios "forke". Le script ./configure est amélioré pour détecter d'éventuel manque de dépendance. Comme par exemple, l'absence de programme de mail sur la station.

Une nouvelle version de Nagios 3.0 (la version alpha 3) est disponible à des fins de test. Les modifications de Nagios 2 sont répercutées sur cette version, notamment celles sur le script ./configure. Des nouvelles fonctionnalités apparaissent avec cette version. La première est l'ajout de la détection automatique d'Apache pour installer automatiquement la configuration du serveur web. Cette fonctionnalité est intéressante, notamment pour simplifier l'installation. La seconde est l'ajout d'informations étendues pour les groupes de hosts et les groupes de services. Enfin, de nouvelles modifications sur la documentation sont en cours.

La version 1.4b3 est sortie principalement pour être compatible avec Nagios 3.0a3. En effet, les changements dans cette version impacte ce module. Étant donné qu'il stocke les données en base de données, l'ajout de nouvelles structures (les informations étendues pour les groupes) nécessitent leur stockage. Bien entendu, cette version corrige aussi des bugs.